Un joven detective, Sinichi Kudo, investigando un caso, unos hombres de negro lo capturan y le hacen beber un veneno. Cuando se han ido descubre que se ha vuelto pequeño y con apariencia de un niño de unos 8 años. Se va a vivir a casa de su amiga Ran, con el nombre falso de Conan Edogawa, para que ésta no descubra su auténtica identidad. El padre de Ran, el detective Kogoro Mouri se vuelve famoso gracias a sus acertadas resoluciones de asesinatos mientras aparentemente duerme, y es gracias a que Conan es el que resuelve los casos y para que no le pillen duerme a Kogoro con un dardo y con un transformador de voz pone la voz del detective para hacer creer a la gente que es Kogoro el que resuelve el caso.